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“空间语法”:理解人类基因活性编码的新视角
2024-09-04 09:12  点击:10
  最近,《自然》杂志上发表的一项题为“Position-dependent function of human sequence-specific transcription factors”的研究,由华盛顿州立大学的研究团队主导,揭示了一种新的DNA编码规则——“空间语法”。这一发现为理解基因活性如何在人类基因组中编码提供了关键线索,并可能重新定义科学家们对基因调控机制的认识,特别是那些在发育过程和疾病发生中影响基因表达的基因突变。
 
研究突破性地揭示了一种长久以来隐藏在DNA中的“空间语法”,这一概念有助于科学家们更好地了解转录因子在基因调控中的复杂功能。转录因子是负责启动或关闭基因表达的蛋白质,传统观念认为它们仅作为激活子或抑制子存在。然而,本研究发现,转录因子的功能远比先前所理解的更为复杂。
 
研究者Sascha Duttke教授指出,事实上,纯粹的激活子或抑制子极为罕见,许多情况下,同样的转录因子既可作为激活子也可作为抑制子发挥作用。如果移除一个被认为是激活子的转录因子,预期的结果是基因表达的减弱,但在实际中,只有大约一半的情况下符合这种预期。因此,研究人员推测其中必有其他因素在起作用。
 
进一步的研究表明,转录因子的功能很大程度上取决于它们在基因组中的位置。例如,当转录因子位于基因转录起始位点的上游时,它们往往促进基因的表达;而在下游时,则可能抑制基因的表达。这种位置依赖性决定了转录因子是作为激活子还是抑制子的作用方式。
 
Duttke博士解释说,如同学习一门新语言需要理解其词汇和语法规则一样,理解基因表达模式也需要掌握其位置和上下文信息。通过结合这种新发现的“空间语法”,科学家们能够更深入地探讨基因突变或遗传变异如何影响基因表达,并进一步推动疾病进程的理解。
 
研究者认为,这一发现的潜在应用广泛,至少将彻底改变科学家们研究基因表达的方法论。
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