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纽约大学科学家揭示DNA早期分子改变:HiDEF-seq技术准确检测DNA单链突变
2024-06-20 09:18  点击:23
 纽约大学科学家揭示DNA早期分子改变:HiDEF-seq技术准确检测DNA单链突变
 
纽约大学Grossman医学院的科学家们近日在《Nature》杂志上发表了一项重要研究,他们介绍了一种名为HiDEF-seq(发夹双重增强保真测序技术)的新型测序方法,这项技术能够以前所未有的准确度检测DNA代码中早期发生的分子改变,即在DNA双链中的一条链发生突变之前。
 
研究人员表示,HiDEF-seq技术对于理解健康细胞和癌细胞中突变产生的根本原因至关重要,并且可以帮助我们认识随着年龄增长,人体细胞中遗传突变如何自然积累。这项研究为理解DNA突变的最早期阶段提供了新的视角。
 
DNA由两条链组成,每条链都由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)这四种碱基组成。在正常情况下,这些碱基以特定的方式配对(A与T,C与G),确保DNA代码能够准确复制并传递给下一代细胞。然而,突变是DNA代码中发生的改变,如C-G碱基对可能突变为A-T。
 
大多数突变起源于DNA双链中的单链变化,但此前的检测技术无法准确识别这些变化。HiDEF-seq技术以其高精确度在检测这些变化方面取得了突破,每分析100万亿个碱基对时仅会产生一个错误。更重要的是,该技术能在DNA单链变化转变为永久性的双链突变之前检测到这些变化。
 
纽约大学的Gilad Evrony博士指出,HiDEF-seq技术使我们能够观察到DNA分子改变的最早期迹象。研究团队首先分析了患有聚合酶校对相关息肉病(PPAP)和先天性错配修复缺陷(CMMRD)这两种遗传性疾病的患者的健康细胞。这些疾病与结直肠癌和其他癌症的风险增加有关,并且患者的细胞突变率高于无癌症易感性的个体。
 
通过HiDEF-seq技术,研究人员发现这些患者细胞中的单链DNA变化数量更多,如T与C的错配取代了正常的G与C配对。此外,这些单链变化的模式与两种综合征患者细胞中已知的单链DNA突变模式相似。研究还进一步揭示了人类精子中单链DNA的化学损伤模式,这可能与环境中诱导的DNA损伤过程相似。
 
Evrony博士表示,HiDEF-seq技术为理解DNA损伤和突变背后的分子机制奠定了基础。随着细胞分裂和繁殖,DNA中的单链变化不断发生,尽管大多数变化能够被修复机制纠正,但仍有部分变化可能发展为突变。研究团队计划利用HiDEF-seq技术构建单链DNA错配和损伤的全面数据库,这有助于解释已知的单链突变模式。
 
未来,研究人员希望将HiDEF-seq技术获得的单链DNA损伤图谱与产生的双链突变相结合,以更好地理解并监测环境暴露对DNA的日常影响。遗传学家估计,每个人类细胞中大约有120亿个碱基可能受到损伤或错配,因为遗传代码有两个拷贝。HiDEF-seq技术将为我们提供更多关于这些变化的信息,并可能引领癌症治疗和预防的新方向。
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