金属离子在生物体内发挥着至关重要的作用，参与酶催化、细胞结构维持、物质运输及信号转导等多种生物过程。然而，全面理解金属离子与蛋白质的相互作用及其对生物功能的影响一直是科学界面临的挑战。metaL-TPP方法的出现，为这一领域的研究带来了革命性的突破。
该方法基于蛋白质与配体结合或解离后热稳定性变化的原理，利用广谱金属离子螯合剂EDTA剥夺蛋白质组中的金属离子，并通过定量质谱技术监测由此引发的蛋白质热稳定性变化。由于金属离子的缺失会导致蛋白质热稳定性降低，因此，在质谱数据分析中表现出热稳定性下降的蛋白质被认为是潜在的金属结合蛋白。
通过将metaL-TPP策略应用于人类蛋白质组，研究团队不仅成功鉴定出了一批已知的金属结合蛋白，还发现了许多之前未被注释为具有金属结合活性的潜在金属结合蛋白。这一发现极大地扩展了人们对金属结合蛋白多样性和复杂性的认识。
此外，研究团队还选择了一个具有重要生物功能的潜在金属结合蛋白GFPT2进行了深入的生化验证，将金属调控与细胞内己糖合成通路联系起来，进一步揭示了金属离子在细胞内的具体生化功能。
metaL-TPP方法的开发为金属蛋白质组学研究提供了新的有力工具，有望促进人们对金属结合蛋白功能和机制的深入理解。通过与王初课题组之前开发的机器学习预测金属结合位点的方法相结合，该方法可以系统地发现和鉴定不同物种中的金属结合蛋白，为金属蛋白的生物学功能研究提供重要线索。
该研究工作得到了国家自然科学基金委、科技部和北京科学分子国家研究中心的支持。北京大学前沿交叉学科研究院北大-清华生命联合中心的2022届博士毕业生曾欣、2021届博士毕业生魏田田、化学与分子工程学院2019级博士生王相贺以及王初课题组副研究员刘源为该文的共同第一作者。王初和肖俊宇为该工作的共同通讯作者。
这一研究成果的发表标志着北京大学在金属蛋白质组学研究领域取得了重要进展，并为未来相关研究提供了宝贵的实验工具和方法学支持。
