尽管低度B细胞淋巴瘤通常无法被治愈,但其发展缓慢,不一定会危及生命。然而,在一些患者中,这种肿瘤可能会变得更具侵略性,从而构成更大的威胁。一种名为AID的蛋白质被认为会引发淋巴瘤向更具侵略性的方向发展,这种蛋白质会在整个B细胞基因组中产生突变。但是,这些突变的许多特征和后果仍然未知。
为了更深入地理解AID如何改变基因组并促使淋巴瘤转化,由哥伦比亚大学的Rebecca Leeman-Neill和Uttiya Basu领导的研究团队与香港科技大学的Dong Song和Jiguang Wang领导的团队进行了合作。他们共同研究了一组肿瘤样本,这些样本来自滤泡性淋巴瘤患者,他们的病情已转化为更具侵略性的类型,这被称为双重打击淋巴瘤。
利用患者在疾病发展过程中不同时间点的样本,研究团队对每个肿瘤进行了全基因组测序,以追踪在转化过程中产生的突变。基因组数据显示,转化突变主要集中在许多基因的非编码、超级增强子嵌入的启动子区域,并以出人意料的方式改变了淋巴瘤中的基因表达。
Leeman-Neill说:“我们预计这些区域的突变会影响通常由突变启动子控制的基因的转录,但我们也发现增强子-启动子相互作用被重新连接,影响了其他邻近基因的表达。”
研究人员还调查了PAX5启动子中一种特别常见的转化相关突变的后果,该突变导致增强子-启动子相互作用重新连接,从而启动ZCCHC7基因。这些变化改变了核糖体生物合成,导致淋巴瘤细胞中蛋白质合成发生广泛变化。这包括DNA修复蛋白、肿瘤抑制因子和当前可用疗法靶向的蛋白质合成下降。
这些发现揭示了淋巴瘤进展过程中增强子重定位的普遍存在。Leeman-Neill表示:“这些变化揭示了治疗侵袭性淋巴瘤,甚至预防其发展的潜在机会。”这一重要的研究成果可能会启发新的治疗策略的开发,以更有效地对抗这种具有挑战性的疾病。